علی ربیعی، سخنگوی دولت درباره اظهارات دبیر شورای عالی امنیت ملی مبنی بر اطلاع نهادهای اطلاعاتی از ترور شهید فخری‌زاده، گفت: بنا بر گزارشی که در دولت مطرح شد، وزارت اطلاعات با اشرافی که داشته است، چند ماه قبل و حتی چند روز قبل از حادثه اطلاعات و هشدار لازم را درباره انجام عملیات تروریستی به همراه مکان‌های احتمالی در اختیار سازمان‌ها و نهادهای حفاظتی قرار داده است. آقای شمخانی تعبیر درستی را مبنی بر اینکه درباره ترور ساده‌انگاری شده است به کار بردند. وی افزود: سازمان‌های جاسوسی زیر پوشش ما قرار داشتند و با کمی دقت، می‌توانستیم این جنایت را ناکام بگذاریم.