یحیی بار دیگر جلوی استقلال را گرفت تا نشان دهد گربه سیاه آبی‌ها است. تنها دو شکست در 13 رویارویی با استقلال، آمار درخشانی برای یحیی گل‌محمدی به نظر می‌رسد. این مربی یک بار آبی‌ها را از جدول جام حذفی خارج کرده و یک بار دیگر، این تیم را در فینال جام حذفی شکست داده است. گل‌محمدی که در آخرین بازی‌اش با پدیده استقلال را متوقف کرده، سه بار آبی‌های پایتخت را در جریان بازی شکست داده و هشت بار مقابل این تیم به تساوی رسیده است. با احتساب پیروزی‌های او در جدال‌های حذفی، این مربی پنج بار زمین بازی با استقلال را به عنوان برنده ترک کرده است.

- یحیی در دوران کوتاه حضور روی نیمکت پرسپولیس به عنوان سرمربی، تنها حضور در یک دربی را تجربه کرد. او و تیمش در شهرآورد 76 به تساوی بدون گل با استقلال رسیدند. این مسابقه کم‌اتفاق، آخرین تجربه حضور علی کریمی و مهدوی‌کیا در دربی‌های تهران به شمار می‌رفت. گل‌محمدی پس از شکست  برابر سپاهان در فینال جام حذفی همان فصل، شغلش را از دست داد و پرسپولیس را ترک کرد تا تجربه حضور در دربی دیگری را به عنوان مربی نداشته باشد.

- گل حیرت‌آور وریا غفوری به سیدمهدی رحمتی از میانه‌های زمین، در مسابقه‌ای به ثمر رسید که یحیی گل‌محمدی روی نیمکت باشگاه نفت تهران حضور داشت. وریا با این شوت تماشایی در دقایق پایانی، جدال با استقلال را به تساوی کشاند و جواب گل فرهاد مجیدی را داد تا نفت گل‌محمدی یک امتیاز از حریف آبی‌پوش تصاحب کند. علیرضا بیرانوند، کمال کامیابی‌نیا و وحید امیری در آن مسابقه بخشی از ترکیب نفت تهران بودند. تیم گل‌محمدی در بازی برگشت دست به کار بزرگی زد و استقلال را در ورزشگاه آزادی شکست داد. این مسابقه در هفته بیست و هشتم لیگ برتر سیزدهم، تا آخرین دقایق با تساوی بدون گل دنبال می‌شد اما رضا نوروزی توپ را به تور دروازه حریف رساند تا یک شوک بزرگ به تیم میزبان وارد شود.

- یحیی گل‌محمدی در لیگ برتر چهاردهم هدایت ذوب‌آهن را بر عهده گرفت و اولین تقابلش با استقلال روی نیمکت این تیم را در هفته دهم پشت سر گذاشت. مهدی رجب‌زاده اولین گل این مسابقه را برای تیم میزبان به ثمر رساند اما هاشم بیک‌زاده با یک ضربه سر، بازی را مساوی کرد. گل دوم مسعود حسن‌زاده، اولین پیروزی گل‌محمدی برابر استقلال در تیم جدیدش را رقم زد. دو تیم خیلی زود در جام حذفی به هم برخورد کردند و این بار هم ذوب‌آهن بود که به عنوان تیم برنده از زمین خارج شد. سفید و سبزها در ضربات پنالتی، استقلال قلعه‌نویی را کنار زدند و راهی مرحله نیمه‌نهایی جام حذفی شدند. دیدار برگشت دو تیم در لیگ چهاردهم نیز با تساوی یک-یک به پایان رسید. دانیال اسماعیلی‎فر در آن مسابقه، گل امید ابراهیمی را جبران کرد تا ذوب در طول فصل مقابل استقلال بدون شکست بماند. یحیی در لیگ پانزدهم خیلی زود به استقلال برخورد کرد و در ورزشگاه آزادی، یک نتیجه درخشان دیگر را به دست آورد. این تیم با گل‌های احسان پهلوان و مرتضی تبریزی، توانست استقلال را در تهران شکست بدهد. در دیدار برگشت لیگ برتر پانزدهم، هیچ گلی بین ذوب و استقلال رد و بدل نشد و مسابقه در فولادشهر، با تساوی بدون گل به پایان رسید. فینال جام حذفی در پایان لیگ پانزدهم، فرصت خوبی برای استقلالی‌ها بود تا از حریف انتقام بگیرند اما این اتفاق هرگز رخ نداد و باز این ذوب‌آهن بود که حریف را غافلگیر کرد. پسران گل‌محمدی باز هم در ضربات پنالتی حریف را بردند و قهرمانی جام حذفی را روبه‌روی نگاه مبهوت استقلالی‌ها جشن گرفتند. روند بی‌شکستی یحیی در دوئل با استقلال، بالاخره در لیگ برتر شانزدهم شکسته شد. او و تیمش در ورزشگاه آزادی، با نتیجه دو بر یک به استقلال باختند. مدتی بعد از این نتیجه، گل‌محمدی از باشگاه ذوب‌آهن جدا شد.

- برخلاف دوران حضور در نفت و ذوب‌آهن، روبه‌رو شدن با استقلال روی نیمکت تراکتورسازی برای یحیی گل‌محمدی خوش‌یمن نبود. این مربی فصل گذشته در هفته سوم با استقلال مواجه شد و در ورزشگاه آزادی نتیجه را با یک گل به تیم میزبان واگذار کرد. در دیدار برگشت نیز دو تیم در تبریز به تساوی بدون گل رسیدند تا یحیی به عنوان سرمربی تراکتور، سابقه شکست دادن استقلال را نداشته باشد.