یاسین ضیا، رئیس ستاد ارتش افغانستان در واکنش به گفته‌های علی شمخانی، توئیت کرده است: «متأسفانه درک شما به عنوان دبیر شورای عالی امنیت ملی ایران نسبت به جنگ جاری در افغانستان نادرست است؛ طالب در برابر مردم افغانستان می‌جنگد نه در برابر آمریکا.» وی افزود: «در برابر هر گروه از دشمنان مردم افغانستان با قاطعیت عمل می‌کنیم.» شمخانی، روز چهارشنبه پس از دیدار با هیأت طالبانی در ایران در توئیترش نوشت: «رهبران این گروه را در مبارزه با آمریکا مصمم دیدم. کسی که سیزده سال در گوانتانامو زیر شکنجه‌های آنان بوده، مبارزه با آمریکا در منطقه را کنار نگذاشته است.»