جواد اطاعت، استاد دانشگاه و از دوستان نزدیک دکتر فقهی در ویدئویی که از او منتشر شده از موضوع نفوذ در جنگ 12 روزه می‌گوید و تاکید می‌کند: من آخرین نفری بودم که با او صحبت کردم. ما قرار کوه رفتن داشتیم که دکتر با من تماس گرفت و گفت به من گفتند از منزل خارج نشوید. این یعنی اینکه مخصوصا او را در منزل نگه داشتند و به جای امن نبردند.  همسر دکتر فقهی هم این موضوع را در کامنتی تایید می‌کند و می‌نویسد با اینکه می‌دانستند اسم دکتر در لیست ترور است، اما هیچ کاری برای او نکردند یادآور می‌شود «سید امیرحسین فقهی»، معاون پیشین رئیس سازمان انرژی اتمی و رئیس پژوهشگاه علوم و فنون هسته‌ای در دولت سیزدهم در حمله بامداد روز جمعه اسرائیل به برخی از مناطق در ایران از جمله مناطق مسکونی در تهران به شهادت رسید.