محمد مهاجری، فعال سیاسی اصولگرا، در نامه‌ای به مصطفی رستمی، نماینده رهبر در دانشگاه‌ها از اخراج بی‌رویه اساتید انتقاد کرد.  مهاجری نوشت: حتما اطلاع دارید از ابتدای روی کارآمدن دولت سیزدهم، موجی از اخراج اعضای هیات علمی دانشگاه‌ها در سراسر کشور ایجاد شده است. در ادامه این نامه آمده است: برای هریک از اخراج‌ها دلیلی عنوان شده یا تراشیده‌اند. عده‌ای را به‌دلیل مسائل اداری(مثلا پایان قرارداد و...) و گروهی را به بهانه ضعف علمی کنار گذاشته‌اند.اما حتی خواجه‌حافظ شیراز هم می‌داند اکثر قریب به اتفاق این برکناری‌ها به دلیل اختلاف مذاق سیاسی اساتید یادشده با طرز فکر جناح حاکم بر آقای رئیسی و دولت اوست. وی ادامه داده ‌است: برداشت این است که سیاسیون حاکم که نماینده اقلیت‌ کوچکی از جامعه‌اند حتی رئیس نهاد نمایندگی رهبری در دانشگاهها را هم در جریان نمی گذارند. اما اگر این فرض غلط باشد، باید بپذیریم جنابعالی بر همه اخراج‌ها مهر تایید زده اید؟ در ادامه این نامه می‌خوانیم: افرادی که نسبت به شما شناخت دارند ، چنین تصوری را غلط می‌دانند اما باز هم  اشکال به جای خود باقی است که آیا اساتید اخراجی از شما تظلم خواهی کرده‌اند؟ اگر کرده‌اند نتیجه چه بوده؟ و اگر کسی به شما برای این کار مراجعه نکرده،تسلیم این واقعیت شده که از شما کاری برنمی‌آید و خالص سازان  چهارنعل به سوی مقصد خود می‌تازند؟ مهاجری در ادامه می‌نویسد: به جنابعالی این است که دلیل واقعی(نه اعلامی) برای اساتید اخراجی را کشف و بی هیچ ملاحظه ای در رسانه ها منتشر کنید. شجاعتش را دارید. ندارید؟