رهبر انقلاب اسلامی با صدور پیامی درگذشت حجت‌الاسلام جواد اژه‌ای را تسلیت گفتند. در این پیام «تشکیل انجمن‌های اسلامی دانشجویان در اروپا، تشکیل مدارس استعدادهای درخشان کشور، مدیریت پدرانه بر مجموعه‌های نخبگانی جوان و سازنده در دوران طلائی مدال‌آوری‌های علمی بین‌المللی» از جمله‌ یادگارهای بی‌همانند این شخصیت برجسته عنوان شده و آمده است: این مجاهد خاموش که خود برادر شهیدی عزیز و داماد شهید عالیقدر آیت‌الله بهشتی بود بنای نخبگی و نخبه‌پروری را بر شالوده‌های محکم ایمان وانقلاب استوار ساخت و سپیدروی و سرافراز به ملاقات خداوند رحیم شتافت.